高通量测序检测肺炎婴幼儿抗生素治疗前后肠道菌群变化

目的 了解抗生素对肺炎婴幼儿肠道菌群多样性和结构的影响.方法 选取5例1岁以内因轻度社区获得性肺炎住院的患儿,收集抗生素治疗前及治疗后第3～5天的粪便标本.利用Illumina MiSeq测序平台,对细菌的16S rRNA基因V3～V4区进行高通量测序,并对测序结果进行生物信息学分析.结果抗生素治疗后第3～5天婴幼儿肠道菌群的多样性明显下降.变形菌门的相对丰度在3例婴幼儿的肠道中下降;厚壁菌门的相对丰度在4例婴幼儿的肠道中下降;而拟杆菌门的相对丰度在4例婴幼儿的肠道中上升;厚壁菌门与拟杆菌门的比例下降.肠道内不动杆菌属、喜胆汁菌属、埃格特菌属、肠球菌属、支原体、颤螺菌属、紫单胞菌属、普雷沃菌属和真杆菌属增长1倍以上;奇异菌属、双歧杆菌属、黄杆菌属、乳酸菌属、链球菌属、萨特菌属和韦荣球菌下降超过50％.结论 婴幼儿短期使用抗生素治疗肺炎后,肠道菌群的多样性下降,肠道微生态失衡.