基于高通量测序和传统分离研究雪茄外包皮表面细菌多样性及演替

细菌在烟叶发酵过程中起着重要作用, 为探索烟叶的发酵机理, 采用Illumina miseq高通量测序技术 (Highthroughput sequencing, HTS) 和传统微生物分离方法, 对墨西哥不同发酵时期雪茄外包皮表面细菌群落结构、丰富度及演替进行研究. (1) HTS获得有效序列条数514 641条, 包含65个OTUs, 主要种属为棒状杆菌属 (Corynebacterium) 、葡萄球菌属 (Staphylococcus) 、不动杆菌属 (Acinetobacter) 、假单胞菌属 (Pseudomonas) 、芽孢杆菌属 (Bacillus) 等.HTS结果表明, 墨西哥雪茄外包皮表面细菌群落组成丰富, 细菌群落结构随发酵进程而变化, 优势微生物由棒状杆菌属 (44.64％) 和假单胞菌属 (40.88％) 演替为后期的葡萄球菌属 (72.78％).α多样性结果表明FJQY-1和FJQY-2样品的细菌群落具有较高的丰富度.β多样性分析发现FJQY-2、FJQY-3和FJQY-4三个样品细菌结构及丰度较为相似. (2) 传统分离结果显示, 不同发酵时期雪茄外包皮表面细菌主要为芽孢杆菌属 (55.10％) 和葡萄球菌属 (22.45％), 与HTS结果比较, 单一传统分离方法不能全面反映不同时期雪茄外包皮表面细菌群落结构和演替.本研究表明, 在不同发酵时期, 雪茄外包皮表面细菌发生着群落演替;HTS测序在揭示微生物群落演替中发挥了重要作用;传统微生物分离鉴定方法不能全面反映微生物多样性及群落演替, 但能获得发酵过程中的部分微生物用于后期功能研究.