基于高通量测序技术研究成年大熊猫肠道菌群

选取6只成年健康大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)、1只成年亚健康大熊猫,基于高通量测序技术,测定其肠道内细菌及真菌组成,研究性别和健康状况对成年大熊猫肠道微生物的影响,分析不同年龄段大熊猫肠道菌群的差异.结果表明,在门水平,成年大熊猫肠道内细菌主要为Proteobacteria和Firmicutes,真菌主要为Ascomycota和Basidiomycota.在属水平,成年大熊猫肠道细菌为Escherichia、Streptococcus、Clostridium及Leuconostoc,真菌为Humicola.雌性和雄性大熊猫肠道菌群没有显著性差异(P＞0.05),健康大熊猫肠道细菌Esherichia、Clostridium(53.33％、1.10％)的含量比亚健康大熊猫(2.48％、0.00％)高,Streptococcus (22.88％)的含量比亚健康大熊猫(48.15％)低,健康大熊猫肠道真菌的多样性高于亚健康大熊猫.与文献比较发现,大熊猫肠道内菌群多样性为成年＞老年＞亚成体,随年龄增长,成年时Streptococcus (22.88％)、Leuconostoc (2.97％)和Clostridium (1.10％)的含量升高,Shigella (6.25％)和Citrobater (2.50％)的含量降低,老年时Weissella (16.67％)的含量升高,Leuconostoc (2.97％)和Clostridium (1.10％)的含量降低.本研究结果表明身体健康状况和年龄对大熊猫肠道微生物菌群结构组成有影响,成年大熊猫性别对肠道菌群没有影响.