南极三洋藓(Sanionia uncinata)细菌群落组成分析

Microbiology(2020)

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摘要
[背景]南极苔藓中蕴藏着丰富的极地微生物资源,然而目前对南极苔藓细菌群落组成的研究较少,限制了对这类极端生境微生物资源的开发和应用.[目的]在南极长城站不同地点随机取样,揭示南极三洋藓(Sanionia uncinata)的细菌群落结构组成.[方法]采用Illumina HiSeq高通量测序技术对3个苔藓样品的16S rRNA基因V4区进行测序及生物信息学分析.[结果]3个苔藓样品中共获得细菌总优化序列273 367条.基于97%序列相似度,细菌优化序列聚类为9 579个OTU.分类地位明确的细菌可归为14门27纲50属.优势类群是变形菌门(Proteobacteria) (30.70%)、拟杆菌门(Bacteroidetes) (19.67%)、疣微菌门(Verrucomicrobia) (12.43%)、蓝细菌门(Cyanobacteria) (10.55%)及放线菌门(Actinobacteria) (9.36%).在属水平上,56.73%属于未知细菌.[结论]南极三洋藓(Sanioniauncinata)中具有丰富多样的细菌,该研究为今后极地微生物研究奠定了基础.
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