草鱼IRE1-like基因的克隆、组织表达及其对微囊藻毒素-LR的响应
Acta Hydrobiologica Sinica(2020)
Abstract
为了研究内质网应激相关基因需肌醇酶1(Inositol-requiring enzyme 1, IRE1-like )的结构和生物学功能及其在草鱼(Ctenopharyngodon idella)响应微囊藻毒素-LR(MC-LR)中的作用,研究根据草鱼转录组测序结果得到该基因家族成员IRE1-like的EST序列,采用RACE技术获得了草鱼IRE1-like基因的cDNA全长序列(登录号:MG797683).该基因序列全长3595 bp, 包括3093 bp开放阅读框, 编码1030个氨基酸, 分子量为116.24 kD, 理论等电点为6.26,具有跨膜结构和信号肽.草鱼IRE1-like基因包含Luminal (39—307 aa)、STKc (569—834 aa)和RNase (837—915 aa)三个结构域.同源性和系统进化树结果表明草鱼IRE1-like基因与斑马鱼IRE1-α基因亲缘关系最近.荧光定量PCR(qRT-PCR)检测结果表明,草鱼IRE1-like基因在肝脏组织中的表达量最高,在肌肉、脾脏、鳃和心脏等其他8种不同组织中也均有表达.不同剂量MC-LR诱导草鱼24h和96h后, 25 μg MC-LR/kg BW和100 μg MC-LR/kg BW剂量组中草鱼肝脏IRE1-like基因表达水平分别在24h和96h显著上升(P<0.05).以上结果初步说明了草鱼IRE 1-like基因可能在MC-LR诱导草鱼内质网应激中起着重要的作用,为进一步研究草鱼IRE1-like基因的功能奠定了基础.
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