基于转录组数据的意大利蝗微卫星位点分析与分子标记开发

[目的]意大利蝗Calliptamus italicus (L.)是新疆荒漠半荒漠草原重要害虫.本研究利用已获得的意大利蝗转录组数据,鉴定其微卫星位点.[方法]使用MISA筛选SSR位点,利用Primer Premier 5设计引物,通过PCR扩增对引物进行验证.[结果]在意大利蝗转录组数据库中,共检测出156 500个SSR位点,分布在126 369条unigene中.其中,单核苷酸重复为60.88％,二核苷酸重复为23.58％,三核苷酸重复和四核苷酸重复分别为12.99％和2.04％.单核苷酸重复主要为A/T(44.38％),二核苷酸重复主要为AC/GT (12.99％)和AG/CT(8.05％).基于筛选的SSR位点设计引物,随机挑选24对引物,对10个不同地理种群意大利蝗成虫DNA样品进行PCR扩增,共有6对引物扩增成功.[结论]本研究利用转录组数据发掘意大利蝗SSR位点,为意大利蝗分子标记、种群遗传及功能基因等研究奠定基础.