基于高通量测序的老年人肠道菌群多样性分析

Chinese Journal of Microbiology and Immunology(2020)

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Abstract
目的:利用高通量测序技术,研究老年人肠道菌群多样性随年龄变化的特点。方法:招募90例健康志愿者为研究对象,按年龄进行分组,其中<60岁(中青年组)为基线对照Age A组,年龄≥60岁者以每10岁为一个年龄段分为Age B、Age C、Age D、Age E 4组。采集研究对象粪便样本,提取DNA,采用二代高通量基因测序技术,对16S rDNA V3~V4高变区进行扩增测序、生物信息学分析,比较不同年龄老年人群肠道菌群和功能基因的差异。结果:在门水平上,不同年龄组肠道菌群组成包括厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、放线菌门4个主要门,其中占比最高的是厚壁菌门,占60%以上,其次为拟杆菌门;从属水平上,粪杆菌属( Faecalibacterium)随着年龄增加丰度不断降低。α多样性分析显示,不同年龄老年人肠道菌群的丰度较高,均匀度较好,各组间无明显差异性;但是β多样性分析发现,Age A组和Age B组群落结构组成差异较大;Age B组和Age C组群落结构相似性最高。 结论:从中青年过渡到60岁以上,肠道菌群的群落结构发生了变化,在60~80岁趋于相对稳定,年龄超过80岁其菌群结构再次发生变化,老年人慢性炎症性疾病、代谢性疾病和肿瘤多发可能与 Faecalibacterium菌的降低有关。
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The elderly,Gut microbiota,High-throughput sequencing,PICRUSt
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