65个马铃薯品种(系)指纹图谱构建和遗传多样性分析

Journal of Agricultural Biotechnology(2020)

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Abstract
马铃薯(Solanum tuberosum)种质资源是马铃薯遗传育种的重要组成部分.本研究利用SSR标记和表型性状分析65个马铃薯品种(系)的遗传多样性.29对SSR引物在65个品种(系)中,扩增出100个多态性条带,引物平均多态条带比率(percentage of polymorphic bands,PPB)为65.77%.SSR分析显示,65个马铃薯品种(系)的平均Nei's遗传多样性(Nei's genetic diversity,H)和平均Shannon指数(Shannon index,I)分别为0.35和0.52,遗传相似系数在0.62~0.91之间,在遗传相似系数0.67处可将供试品种(系)分为3个类群.群体结构分析可将65个马铃薯品种(系)划分为3个类群,两种分类结果基本吻合.利用5对SSR引物构建了65个品种(系)的DNA指纹图谱.32个表型性状的分析表明,23个性状变异系数高于30%,供试群体I和H分别为0.94和0.55,65个品种(系)遗传相似系数在0.29~0.75之间,多个表型性状之间表现出显著的相关性,其中皮色和茎色、肉色与芽眼深浅呈显著正相关(P<0.01).主成分分析(principal component analysis,PCA)发现,12个主成分(principal component,PC)解释了65个品种(系)74.54%的表型变异.对分子标记和表型性状调查的结果进行QR编码,可便捷的查看和鉴定65个品种(系)的遗传特征.本研究构建了65个品种(系)的指纹图谱,分子标记结合表型性状的结果显示,65个马铃薯品种(系)的遗传多样性处于中等水平,有待进一步引进和利用新的种质资源.本研究将为马铃薯种质资源的利用、品种鉴定和品种知识产权保护提供依据.
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