基于单核苷酸多态性鉴别小梅山猪及其制品

小梅山猪(Sus scrofa)是太湖流域独特的地方猪品种,具有肉质鲜美等特点,市场上存在小梅山猪及其肉制品的假冒问题,而传统鉴别技术在实际应用中具有一定的局限性.本研究利用第3代分子标记一单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)开发小梅山猪及其制品的分子标记鉴定方法,将小梅山猪与太湖流域其他6个品种及常见西方品种猪进行鉴别区分.对于太湖流域7个品种(品系)(中梅山猪、小梅山猪、二花脸猪、米猪、嘉兴黑猪、枫泾猪和沙乌头猪)和西方5个引进猪品种(杜洛克、长白猪、大白猪、皮特兰、巴克夏)进行简化基因组测序(genotyping by genome reducing and sequencing,GGRS),筛选出小梅山猪与其他猪种具有差异的5个SNP位点,采用Sanger测序进行验证.结果表明,上述5个SNPs在小梅山猪中存在较高等位基因突变率,利用5个候选位点的组合可达到鉴定概率99.35％、准确率100％,无假阳性错判.本研究为小梅山猪遗传资源保护、假冒伪劣品种辨别提供了参考依据.