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大豆荚粒数相关QTL的Meta和Overview分析及其候选基因预测

Journal of Agricultural Biotechnology(2018)

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Abstract
荚粒性状与大豆(Glycine max)产量密切相关.本研究利用完备区间作图法(inclusive composite interval mapping,ICIM)对两年的重组自交系(recombinant inbred line,RIL)群体数据进行分析,获得7个与荚粒性状相关的数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL),并搜集了国内外已报道的154个荚粒性状相关QTLs.利用元分析(Meta-analysis)方法得到23个Meta-QTL区间,利用基于统计学原理的Overview方法对这些QTL区间进行优化.经Overview分析,获得13个有效的QTL区间,5个QTL区间被缩小到0.5 Mb.对Meta-QTL区间进行基因注释,获得687个基因,筛选11个基因作为候选基因.11个候选基因参与植物生长发育、果实成熟等过程.本研究建立的实验方法及研究结果,对于大豆荚粒性状QTL定位及分子辅助育种提供了基础资料.
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Key words
seed traits,soybean,qtl,candidate gene mining
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