基于微卫星多重PCR技术的长鳍吻鮈亲子鉴定

微卫星多重PCR技术在生物的亲子鉴定、群体遗传分析以及家系管理等方面均得到了广泛的应用.长鳍吻鮈(Rhinogobio ventralis)是我国长江上游特有珍稀鱼类,目前已达3级急切保护状,被列为低危鱼类.为了提高长鳍吻鮈微卫星分型效率,本研究从已开发的微卫星中筛选出15个多态性较高的微卫星位点进行组合扩增,并对位点组合的引物浓度、退火温度和反应体系等条件进行优化,建立了5组各含3个微卫星位点多重PCR体系.利用5组微卫星多重PCR,通过ABI 3730测序仪和Cervus v.3.0软件对136尾长鳍吻鮈进行个体基因型检测以及遗传多样性分析,结果显示,群体的平均等位基因数(number of allele,Na)为15.600,平均期望杂合度(expected heterozygosity,He)为0.825,平均观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)为0.813,平均多态信息含量(polymorphism information content,PIC)为0.801.对40尾候选亲本和96尾子代进行亲子鉴定分析,结果显示,第一亲本的累积排除概率(combined exclusion probability of the first parent,CE-1P)、第二亲本累积排除概率(combined exclusion probability of the second parent,CE-2P)和双亲累积排除概率(combined exclusion probability ofa parent pair,CE-PP)分别为0.999986 07、0.999 999 97和1.000 000 00.使用该5组微卫星多重PCR体系进行亲子鉴定准确率为100％.长鳍吻鮈微卫星多重PCR技术的建立为亲子鉴定、分析群体遗传多样性和辅助家系管理提供了一种高效的技术手段.