肝癌患者外周血单个核细胞circRNAs诊断价值分析
Immunological Journal(2019)
摘要
目的 探讨肝细胞癌(HCC)患者外周血单个核细胞(PBMCs)中环状RNA (circ RNAs)作为HCC分子标志物的临床诊断价值.方法 利用高通量测序(RNA-seq)获取4例HCC患者和3例健康对照者(NC组)PBMCs中circRNAs的差异表达谱,GO/KEGG分析差异表达的circRNAs显著富集的潜在功能和信号通路;qRT-PCR对其中6种显著差异的circRNAs在72例HCC患者和30例健康对照者PBMCs样本中再次验证;最后结合ROC曲线(ROC)评估circ_0000798作为HCC分子诊断标志物的潜力.结果 RNA-seq鉴定出HCC组较NC组共有58种显著差异的circRNAs(21种上调,37种下调);GO/KEGG分析发现差异表达的circRNAs多涉及免疫和免疫相关的信号通路;qRT-PCR结果表明circ_0000798在HCC患者PBMCs中表达显著高于NC组(P<0.05),ROC曲线分析提示circ_0000798有潜力作为HCC分子诊断标志物.结论 HCC患者PBMCs中显著差异表达的circ_0000798有潜力作为HCC患者无创性诊断分子标志物.
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