大黑毛肩长蝽(半翅目:异翅亚目:地长蝽科)线粒体基因组及地长蝽科系统发育地位探讨

Journal of Environmental Entomology(2017)

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Abstract
为了更加深入地了解地长蝽科的基因组水平特征,测序并分析了大黑毛肩长蝽Neolethaeus assamensis(半翅目:异翅亚目:地长蝽科:毛肩族)的线粒体基因组序列.大黑毛肩长蝽线粒体基因组是双链共价环状DNA分子,长度为17097 bp,编码13个蛋白质编码基因,22个tRNA基因和2个rRNA基因,基因排列方式同果蝇Drosophila yakuba一致.大黑毛肩长蝽线粒体基因组内存在2个大的非编码区.一个是控制区,另一个是位于ND6和CytB之间的串联重复区域,TRR4.4.控制区内包含7类共9个结构显著的区域,如一个茎环结构,3个非串联的重复序列以及其他5个结构区域.TRR4.4长802 bp,包括4个184 bp的重复单元和1个66 bp的部分重复单元.TRR4.4的重复单元与控制区中TRR2.7的重复单元在长度、方向以及核苷酸组成等方面几乎完全一致.22个tRNA全部能够折叠为典型的三叶草二级结构.16S rRNA二级结构包含6个结构域(结构域Ⅲ在节肢动物中缺失)和44个茎环结构,12S rRNA二级结构包含3个结构域和28个茎环结构.基于蝽次目15个线粒体基因组数据分析得到的系统发育结果,支持地长蝽科位于长蝽总科基部分支的观点.
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Mitochondrial genome,Neolethaeus assamensis,tandem repeat,recombination,phylogenetic analyses
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