都柳江南方白甲鱼群体mtDNA D-loop序列及遗传多样性分析
Genomics and Applied Biology(2020)
摘要
为探究都柳江流域南方白甲鱼种群种质资源现状.本研究以采集自都柳江的40尾南方白甲鱼个体为实验样本,使用mtDNA D-loop分子标记技术,得到了长度近700 bp的南方白甲鱼D-loop序列.经分析序列中碱基A、T的含量高于碱基C、G,识别了序列的保守序列区、终止序列区和中央保守区以及相关的核心序列.都柳江南方白甲鱼群体D-loop序列有变异点13个,变异类型包括缺失、插入、转换和颠换.多态位点11个,其中单突变点和简约信息点分别有3个和8个.碱基转换颠换比为4.5∶1,变异尚未达饱和.确定了15个单倍体型.都柳江南方白甲鱼群体D-loop序列单倍型多样性度和核苷酸多样性指数分别为0.877 7和0.003 3.都柳江南方白甲鱼群体近期可能存在扩张现象,但其核苷酸多样性较低,需要开展其种质资源研究和保护.本研究从分子水平上为都柳江南方白甲鱼种质资源的评价、开发和利用提供基础.
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