肠杆菌属细菌一类整合子及其基因盒特征

Minghua Xiong,Jirong Zhu,Rui Yang, Shuyu Wang, Na'na Zang, Hao Wang,Feng Li

Genomics and Applied Biology(2020)

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Abstract
整合子是捕获、整合和表达外源基因的重要元件,可以加速抗生素抗性基因的传播.本研究分析了已完成全基因组测序肠杆菌属细菌一类整合子及其基因盒的存在情况与特征.实验表明,目前62个肠杆菌属细菌,包括40个阴沟肠杆菌、11个霍氏肠杆菌和11个其它肠杆菌都完成了全基因组测序,其中40.32%(25/62)肠杆菌属细菌含有一类整合子.在25个含一类整合子的肠杆菌中,72% (18/25)携带一个整合子,28%(7/25)含有多个整合子.25个肠杆菌共存在36个整合子,其中88.89% (32/36)位于质粒上,其余11.11%(4/36)位于染色体上.肠杆菌属细菌一类整合子整合酶基因(1 014 bp)高度保守,其中一个整合子整合酶基因发生了3碱基突变(3/1 014),7个发生2碱基突变(2/1 014),13个发生1碱基突变(1/1 014 bp),其余没有突变.25个含一类整合子肠杆菌共存在18种基因盒,其中dfrA1基因盒频率最高16.13% (10/62),其次是aadA1(8.06%,5/62),接着是aacA 27-ereA-IS12 47-aac 3-arr2-ereA基因盒(4.84%,3/62),其他基因盒频率低于4.0%.本研究有助于了解一类整合子在肠杆菌属细菌产生抗生素抗药性中的重要作用.
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