一种改良的可直接用于PCR扩增的土壤DNA提取方法

Genomics and Applied Biology(2019)

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摘要
本研究对Zhou氏土壤DNA抽提方法进行了改良,减少了土壤用量、孵育和裂解时间,增加了土壤淋洗和硫酸铝处理步骤.接着比较了改良法和Zhou氏法抽提四种类型土壤DNA的效果.结果 表明,将土壤用量减少至0.4g、孵育和裂解时间分别降至20 min和30 min,极大地简易了操作过程,大幅节省了实验所需时间(约为Zhou氏法所需时间的一半).裂解前增加淋洗步骤和裂解过程中加入硫酸铝都提高了DNA的纯度.前者同时提高了DNA得率,但后者稍微降低了DNA得率.与Zhou氏法相比较,改良法提取4种类型土壤(黑土,黄土,潮土,红土)的DNA在得率和纯度方面均得到提高,并且可以直接用于16S rRNA基因的PCR扩增等分子操作.总之,本改良法简便了DNA提取过程、大大节省了实验时间,可用于从不同类型土壤中抽提适合于PCR扩增等分子操作的DNA.
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