DNA条形码技术在大型红藻分子鉴定中的应用

本研究对浙江省枸杞岛贻贝养殖区大型海藻资源进行了调查,在形态学观察的基础上,选取93株红藻样品运用DNA分子条形码技术进行分子鉴定分析.采用的3个分子标记分别为rbcL(叶绿体基因组中1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶大亚基基因),COI(细胞色C氧化酶亚基D和UPA (23S rRNA基因片段,通用质体扩增区)基因片段.通过实验,我们共扩增出rbcL基因片段79条,扩增成功率为84.95％;共扩增出COI基因片段63条,扩增成功率为67.74％;共扩增出UPA基因片段76条,扩增成功率为81.72％.3个分子标记的测序成功率分别为:rbcL基因78.49％,COI基因29.03％,UPA基因72.04％.COI基因的扩增效率和测序成功率均低于rbcL和UPA基因.基于3个基因构建(Neighbor-joining,N-J)系统进化树表明,rbcL基因可以将红藻样品归类为5目,6科,7属,12种;COI基因可以将样品归类为4目,5科,5属,5种;UPA基因可以将样品归类为6目,7科,8属,11种.rbcL、COI和UPA3个基因结合可以将样品归类为7目8科11属21种.研究表明rbcL基因以及UPA基因较适合做为鉴定大型红藻的分子标记,COI基因做为红藻分子标记的潜力有待进一步开发和研究.