α-硫辛酸作用肺癌细胞的转录组分析
Genomics and Applied Biology（2018）
摘要
为了获得α-LA作用肺癌细胞后的转录组数据库和差异表达基因,我们将A549细胞处理组和对照组作为测试样品,采用Illumina HiSeqTM2000测序技术进行转录组测序,并进行系统的生物信息学分析.对照组和处理组两两比较共获得6 748个差异表达基因.GO (gene ontology)分类分析表明,差异表达基因属于细胞组分、分子功能和生物学过程的46个类别.KEGG Pathway显著性富集分析提示差异表达基因共涉及15条途径,包括肿瘤相关通路、内质网蛋白加工、细胞周期、核糖体、剪接体等相关途径.对α-LA作用肺癌细胞的转录组进行拼接、组装和功能注释,得到大量转录本信息,为探究α-LA作用肺癌细胞后基因差异表达及相关分子机制提供了宝贵的基因组数据库资源.
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