大豆GmDAO1基因的功能预测及表达分析
Genomics and Applied Biology（2017）
Abstract
本研究通过在大豆基因组数据库中检索拟南芥AtDA O1在大豆中的同源基因,获得了GmDAO1基因序列.通过对GmDA O1基因编码的氨基酸序列及启动子序列进行生物信息学分析,我们发现GmDA O1基因CDS序列全长951 bp,编码316个氨基酸.GmDA O1编码的蛋白为亲水性蛋白,具有1个N-糖基化位点、3个激酶磷酸化位点与1个豆蔻酰化位点.结构域分析表明GmDAO1含有双加氧酶与2OG-Fe (Ⅱ)加氧酶结构域,是2-酮戊二酸依赖性双加氧酶基因(2-ODD)家族的成员.GmDA O1预测的启动子区域含有与激素、胁迫、光应答、生物钟调控和转录因子结合相关的顺式作用元件.系统进化分析结果表明DAO1在豆科植物进化过程中比较保守.组织特异性表达分析结果显示GmDA O1在叶片中表达量最低,在根中表达量最高.因此我们推测其可能参与生长素的代谢途径.
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Key words
Soybean,GmDA O1 gene,2-oxoglutarate-dependent dioxygenase,Auxin,Bioinformatics
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