γ-聚谷氨酸的基因克隆与序列分析

Genomics and Applied Biology(2017)

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Abstract
本研究通过基因组DNA提取和PCR扩增分别得到Bacillus natto20646的原初始菌株N-1、高压电晕电场和不同种类稀土元素诱变的突变株N-2、N-3、N-4、N-5及N-6的pgsBCA合成酶基因序列,利用BioEdit软件对6株菌株的pgsB、pgsC和pgsA的基因序列及合成酶蛋白PgsB、PgsC和PgsA蛋白酶的氨基酸序列对比后得出:pgsB、pgsC和pgsA基因分别约含l 170个、450个和1 140个核苷酸,分别编码约390个、150个和380个氨基酸.高压电晕电场和稀土元素使得菌株γ-PGA合成酶基因簇pgsBCA核苷酸发生了碱基的置换和颠换、插入和缺失,合成酶蛋白PgsBCA氨基酸序列发生了氨基酸的替换、插入和缺失,且对序列的开端和尾端的影响较大,PgsA在30~40个氨基酸区间变化显著,使该处氨基酸残基的跨膜区发生变化,准确的膜锚定,γ-PGA高效地从活性中心位点移开,加快实现了链的延长,为γ-PGA产量的提高提供理论基础.
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γ-PGA,γ-PGA synthetase,pgsBCA,Sequence comparison
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