中间锦鸡儿CiMYB31基因克隆及表达分析

MYB类转录因子是植物中最大的转录因子家族之一,在植物的初生与次生代谢、细胞命运、生长发育及在生物与非生物胁迫应答中具有重要的作用.本研究以中间锦鸡儿为实验材料利用PCR技术分别以cDNA与gDNA为模板对CiMY B31基因进行了克隆.研究测序表明:CiMYB31基因的开放阅读框(ORF)为969 bp,编码323个氨基酸,其基因组DNA序列长度为1 724 bp,包含3个外显子与2个内含子.生物信息学分析显示:CiMYB31所编码蛋白的N端包含2个MYB结构域(14～64 aa和67～115 aa),属于R2R3-MYB类蛋白.预测该蛋白分子量为36.32kD,等电点为5.6,蛋白整体上是亲水性的.利用染色体步移技术克隆CiMY B31基因启动子序列,得到902 bp ATG上游序列.分析显示启动子序列中包含一些非生物胁迫相关的顺式作用元件,如干旱响应元件(MBS)与低温响应元件(LTR).利用实时荧光定量PCR技术对CiMYB31基因的表达进行分析,发现该基因受到低温的诱导.上述研究表明CiMYB31基因可能在中间锦鸡儿对非生物胁迫的响应过程中起作用.