拟南芥与水稻AAAP家族基因的鉴定与比较分析
Genomics and Applied Biology（2017）
Abstract
AAAP蛋白广泛存在于各种生物中,在生物生长与发育过程中扮演重要作用.本研究基于生物信息学方法对水稻和拟南芥AAAP进行系统剖析,旨在深入认识该家族基因的序列、表达及进化特征.结果显示:拟南芥包括49个AAAP基因,水稻包括71个AAAP基因,这些基因被分为3个类群,细分为13个亚类群;不同类群基因结构和保守基序均显示较高的多样性,亚类群水平基因结构和保守基序显示出较高的保守性,这说明该家族基因具有多样化的功能;进化树末端的同源基因对之间表达情况分化程度较高,但其进化速率具有较高的同质性,这说明同源基因对的分化主要体现在表达变化上.这些结果有助于研究其它植物AAAP家族基因的功能.
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Key words
Arabidopsis,Rice,AAAP family,Sequence,Evolution
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