江口萝卜猪FABPs主要家族基因SNPs筛选及生物信息学分析

Genomics and Applied Biology(2015)

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摘要
以江口萝卜猪为试验材料构建DNA池,采用直接测序技术对猪L-FABP、I-FABP、H-FABP、A-FA BP基因进行SNPs快速筛查,共检测出7个SNPs,分别为intronl-T1745C、exon2-T125C、exon2-A131C、exon2-C153A、exon2-A65T、exon2-G40A、intron3-C65T.其中intronl-T1745C、imron3-C65T位于内含子上;exon2-T125C、exon2-C153A为同义突变;exon2-A131C、exon2-A65T、exon2-G40A为错义突变,分别使编码氨基酸发生Glu→Ala、Lys→Met、Glu→Lys的改变,对其进行生物信息学分析表明,突变前后的等位基因频率估算,mRNA二级结构预测,蛋白质二级、三级结构预测分析均有差异.
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关键词
Jiangkou Luobo Pig,Fatty acid binding protein gene,SNPs,Bioinformatics
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