解淀粉芽孢杆菌TF28抗菌蛋白TasA基因序列分析及蛋白质结构预测

本研究以解淀粉芽孢杆菌TF28为材料,采用PCR方法从基因组DNA中扩增出抗菌蛋白TasA基因,利用生物信息学方法对TasA基因序列及其编码的蛋白质结构进行分析和预测.结果表明TasA基因全长786 bp,含有一个完整的开放阅读框和一个终止密码子,编码261个氨基酸,经Blast比对,该基因与其它解淀粉芽孢杆菌TasA基因同源性为95％～99％,与B.amyloliquefaciens FZB42 (CP 000560.1) TasA基因序列同源性最高为99％,与B.amyloliquefaciens DSM7 (FN597644.1)的同源性最低为95％.预测该基因编码蛋白质分子量为28 kD,等电点为6.35,是含有信号肽和跨膜结构的亲水蛋白,蛋白结构中含有糖基化和磷酸化位点,二级结构中以α螺旋、β折叠和无规则卷曲为主.