贵州白香猪IL-2、IL-4和IL-6基因的克隆及生物信息学分析

为研究和挖掘贵州地方特色猪种贵州白香猪的遗传种质资源,本实验克隆了该猪种的白细胞介素2(IL-2)、IL-4、IL-6基因,并对其相关遗传信息进行了分析.克隆测序结果表明,IL-2、IL-4和IL-6的ORF大小分别465 bp、402 bp和639 bp,其与猫、牛、狗、马、人、猴、鼠、兔、羊的推导氨基酸的序列相似性分别为57.8％～74.7％、47.8％～87.6％和45.3％～76.4％,与己报道的其它猪种的推导氨基酸的序列相似性均在98％以上.不同猪种间,除IL-4推导氨基酸序列完全相同外,IL-2的差异主要出现在第2位,第87位以及第125位,IL-6则仅出现在第30位和第69位.推导蛋白质特性分析结果表明IL-2、IL-4和IL-6大小分别为17 401.2 Ku、15 022.6 Ku、23 880.5 Ku,均系亲水性蛋白质,信号肽长度分别为20、24、25个氨基酸残基,分别含有27、26和35个磷酸化位点,仅IL-6在7～26位氨基酸之间含有一个跨膜螺旋区.不同猪种间,尽管上述白细胞介素在推导氨基酸水平均存在一定差异,但这些差异并未引起其预测模型空间结构改变,表明其在功能上具有高度保守性.