基于LC-MS-MS技术建立水稻细菌性条斑病菌的蛋白质表达谱的研究

Pingchuan Zhu,Hongping Qin,Shan Fu,Weijian Cen,Haifan Zou,Yongqiang He,Wei Jiang

Genomics and Applied Biology（2015）

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摘要

水稻细菌性条斑病菌(Xamthomonas.oryzae pv.oryzicola,Xoc)是水稻的主要病原菌之一,其引发的水稻细菌性条斑病可造成水稻严重减产.本文利用Xoc GX01作为实验菌株,通过细菌培养、蛋白提取、纯化获得总蛋白,利用高pH值C18反相色谱作为第一维分离方式,再将收集的馏分通过LC-MS/MS技术得到了总蛋白质表达谱,共鉴定蛋白质1 621个,同时利用生物信息学技术对鉴定蛋白进行基因本体(geneontology,GO)生物学分类,对生物功能、生物进程以及细胞组件进行了注释.为明确植物病原菌的作用机理和研究植物-病原微生物互作提供了方法学基础.

关键词

Xamthomonas.oryzae pv.oryzicola,LC-MS/MS,Protein expression profile,Gene ontology

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