宗地花猪和从江香猪ADRP基因多态性及生物信息学分析
Genomics and Applied Biology（2015）
Abstract
为研究宗地花猪和从江香猪ADRP基因的单核苷酸多态性,为选种选育提供理论参考,试验以宗地花猪和从江香猪为对象,构建DNA池,采用PCR产物测序法对A DRP基因8个外显子进行单核苷酸多态性检测,并利用生物信息学方法对A DRP基因编码产物进行结构功能预测.结果显示,在两个猪种ADRP基因中筛查到5个SNPs,分别是T37C、T140C、G777A、A1061G、A1117G,其中T37C位于非编码区内,T140C和A1061G为同义突变,G777A (Val→Ile)和A1117G (Asn→Ser)为错义突变;突变前后ADRP基因mRNA二级结构、编码蛋白二级结构及三级结构均发生了变化.研究结果表明,宗地花猪和从江香猪ADRP基因具有较高的遗传多样性,可为猪种的选育和创新提供参考.
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Zongdihua pig,Congjiangxiang pig,ADRP,Exon,SNPs
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