基于高通量测序技术对沙湖水体细菌多样性的分析

为了解沙湖水体中细菌群落结构和多样性,采用E.Z.N.A. 水样DNA提取试剂盒提取水样总DNA,对细菌群落的16S rRNA基因的V4~V5区进行MiSeq测序,利用Mothur软件和R语言进行细菌群落结构及多样性的分析.共得到427975条优化序列,在97%的相似水平下对OTU进行统计分析,得到20门,50纲,95目,161科,276属.样点A、B、C、D的OTU分别为497、496、487和511.优势类群为变形菌门(Proteobacteria)、蓝细菌门(Cya-nobacteria)、放线菌(Actinobacteria)、拟杆菌(Bacteroidetes).沙湖水体中细菌群落结构复杂,但不同位点细菌群落结构的组成以及多样性差异不显著.