春性甘蓝型油菜BnFY34基因的克隆及序列分析

Guihaia(2018)

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摘要
春性甘蓝型油菜杂交种由于发育期较长,极大地限制了该油菜在高寒地区的推广.为了从春性特早熟甘蓝型油菜中筛选出苗期和蕾期差异表达的基因,该研究以春性特早熟甘蓝型油菜为材料,利用cDNA?AFLP技术筛选出1个春性特早熟甘蓝型油菜苗期特异表达的基因片段,并采用RACE技术成功分离克隆了该基因,命名为BnFY34.通过对该基因的测序和生物信息学分析,发现该基因序列大小为455 bp,包含完整的开放阅读框(ORF),编码一个由71个氨基酸残基组成的蛋白,推测的蛋白质分子量为8.04 kD,理论等电点为10.25,其三级结构中含有3个α螺旋,不含β折叠.同时,将BnFY34基因与甘蓝型油菜基因组序列进行比对,结果显示BnFY34基因位于C4染色体上,由3个外显子和2个内含子组成.另外,通过对该基因与其他植物同源基因的亲缘关系进行了分析,结果表明BnFY34基因与芸薹属植物属于同一亚族,并且与甘蓝型油菜中已报到的未诠释基因XM 013837282.1的相似度达100%,其功能有待进一步研究.该研究结果对春油菜产量和品质的早熟转基因育种具有重要意义.
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关键词
Brassica napus,development,gene expression,cDNA?AFLP
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