马铃薯St4CL的克隆及表达分析

4-香豆素辅酶A连接酶(4CL)是苯丙烷代谢途径中关键酶之一,克隆马铃薯4CL,并分析其表达情况,为马铃薯4CL的功能研究奠定基础.从马铃薯青薯9号中克隆St4CL,并进行生物信息学分析,采用qRT-PCR技术检测St4CL在青薯9号各组织中以及不同马铃薯品种中的表达量.结果表明,St4CL的CDS长度为1710 bp,编码569个氨基酸,蛋白分子质量约为61.83 kD,等电点为5.53.生物信息学分析表明,St4CL蛋白是稳定的疏水性蛋白,具有无规则卷曲(42.36％)、α-螺旋(28.47％)、延伸连(21％)、β-折叠(8.08％);亚细胞定位预测显示,St4CL位于叶绿体类囊体膜上;系统进化分析表明,St4CL蛋白与番茄的Sl4CL蛋白亲缘关系最近,二者同源性为97％.St4CL启动子区域含有多种与逆境响应相关的顺式作用元件,如脱落酸响应元件、赤霉素响应元件以及与干旱和黄酮类生物合成相关的MYB结合位点.qRT-PCR结果显示,St4CL在青薯9号各组织中均有表达,叶片中表达量最高,花中次之,根中表达量最低;在不同马铃薯品种中的表达量存在差异,在高抗晚疫病品种青薯10号中表达量最高,感病品种下寨65中的表达量最低.