沙冬青 AmCIP 基因结构及其内含子生物信息学分析

旨在分析沙冬青 AmCIP 基因 DNA 序列结构特性及功能。以沙冬青 AmCIP 基因的 cDNA 序列设计引物，采用 PCR扩增其 DNA 序列，并利用生物信息学方法分析基因的结构。序列分析表明，沙冬青 AmCIP 基因 DNA 序列长1548 bp，包含2个外显子和1个内含子，GenBank 登录号 KU744005。在该基因的 ORF 内存在一个78 bp 的内含子序列，同时内含子序列中含有参与厌氧诱导的类增强子元件（GC-motif）和光响应元件（TCCC-motif），3'-UTR 区域含有多个参与光响应、胁迫响应和激素响应等相关的顺式作用元件，而5'-UTR 区域只含有赤霉素响应元件（GARE-motif），这些元件可能对 AmCIP 基因转录表达起调控作用。此外，该基因具有较高的 A+T 碱基含量（64.7%），AmCIP 的内含子不具有 GT-AG 规则的保守序列，即内含子5'碱基是 GT，3'碱基是 TG，推测 AmCIP 的 mRNA 具有独特的剪切机制。