水稻盐胁迫相关内含子microRNA的表达及其生物发生机制

Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology(2017)

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Abstract
内含子microRNA是一类位于编码基因内含子区域的非编码小RNA.目前,动物内含子microRNA研究报道较多,而关于植物体内含子microRNA的功能及其生物发生机制报道较少.本研究通过高通量测序技术,结合生物信息学方法,发现在盐胁迫条件下水稻幼苗中共85个内合子microRNAs表达,其中差异表达的有24个.预测到的51个靶基因的功能分析,主要涉及抗氧化途径、植物激素信号转导途径及功能基因表达调控途径.此外,根据宿主基因的表达情况推测,共30个内含子microRNAs具有独立表达的功能.通过分析内含子microRNA前体DNA片段上游1 kb序列中的启动子核心元件,初步验证其具有独立表达的能力.因此,推测水稻幼苗在盐胁迫条件下,部分内含子microRNA独立于宿主基因表达,并参与水稻盐胁迫下的自我防御机制.
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intronic microRNA,rice,high throughput sequencing,target gene,biological mechanism
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