羽衣甘蓝不同组织及柱头发育实时荧光定量PCR内参基因的筛选

Bulletin of Botanical Research(2016)

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摘要
以羽衣甘蓝(Brassica oleracea var.acephala)S13-bS13-b自交不亲和系为试材,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测Actin、Cpi6、EF-1β、GAPDH、Tub-α3、Tub-α6、Ubc7候选内参基因在不同组织和5个不同发育时期柱头的表达情况,并运用geNorm和BestKeeper软件统计分析候选内参基因的表达稳定性.在不同组织中,geNorm软件统计分析的结果表明Tub-α6和EF-1β的表达较稳定;BestKeeper软件统计分析的结果表明Ubc7和Tub-α6的表达较稳定.在不同发育柱头中,geNorm软件统计分析的结果表明Actin和Ubc7的表达较稳定;BestKeeper软件统计分析的结果表明EF-1β和Tub-α6的表达较稳定.以筛选到的内参基因Tub-α6和Actin,分别分析羽衣甘蓝柱头S-位点糖蛋白基因(SLG)在不同组织和不同发育时期柱头的表达水平,结果显示出SLG主要在柱头中表达,而且SLG在柱头发育成熟时期表达量达到最高.
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关键词
Brassica oleracea var.acephala,real-time quantitative PCR,reference genes,stigma development,SLG
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