人白细胞介素-36受体拮抗剂的二级结构及B细胞表位的预测
Biotechnology(2015)
Abstract
[目的]预测人白细胞介素-36受体拮抗剂(interleukin-36 receptor antagonist,IL-36Ra)蛋白的特性及其B细胞抗原表位.[方法]以人IL-36Ra基因序列为基础,应用Expasy工具中ProtParam程序分析人IL-36Ra蛋白的氨基酸组成、理化性质和二级结构;采用ProtScale网络服务器预测亲水性和柔韧性;采用Emini和Kolaskar方案分析其可及性.结合其二级结构的特性,进一步预测IL-36Ra的B细胞抗原表位.[结果]人IL-36Ra的二级结构主要由无规则卷曲(44.52%)、β折叠(30.97%)、α-螺旋(18.06%)和β-转角(6.45%)组成.IL-36Ra蛋白肽链的36-37、72-79、91-96、103-110、126-130和134-138区段为B细胞表位区域的可能性较大.[结论]该研究采用多参数方案综合预测人IL-36Ra蛋白的二级结构和B细胞表位,为深入鉴定IL-36Ra的抗原表位及试验方法探索其单克隆抗体奠定了理论基础.
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