颈棱蛇蛇毒金属蛋白酶基因扩增及系统进化分析

Biotechnology(2015)

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摘要
[目的]扩增颈棱蛇蛇毒金属蛋白酶基因,并对其进行系统进化分析.[方法]通过PCR方法扩增颈棱蛇蛇毒金属蛋白酶基因,使用Lasergene MegAlign 8.1.3软件对多个蛇种的蛇毒金属蛋白酶序列进行比对,使用MEGA 6.06对颈棱蛇和其它蛇种的蛇毒金属蛋白酶氨基酸序列进行进化分析.[结果]颈棱蛇蛇毒金属蛋白酶编码区长1 854 bp,编码617个氨基酸残基.该酶的核酸序列与绿栖林蛇、银环蛇、舟山眼镜蛇、圆斑蝰蛇和尖吻蝮蛇的序列相似度分别为82.1%、79.2%、79.1%、75.2%和75.7%,氨基酸序列相似度分别为68.9%、63.3%、63.1%、60.3%和60.1%.进化分析显示,颈棱蛇和同属于游蛇科水游蛇亚科的波加丹游蛇亲缘关系最近,其次为游蛇科美洲钝头蛇亚科的绿栖林蛇,与眼镜蛇科和蝰科这两个科亲缘关系最远,与非洲蛇科的小鳞穴蝰亲缘关系介于游蛇科和眼镜蛇科之间.[结论]蛇毒金属蛋白酶可以作为蛇种进化分析的一种重要参考基因.
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