冬瓜BhMAPK15基因的克隆及其非生物胁迫下的表达分析
Chinese Journal of Cell Biology(2020)
Abstract
该文为探究MAPK15基因的结构和功能,根据冬瓜(Benincasa hispida (Thunb.) Cogn.)转录组高通量测序结果,采用RT-PCR方法从冬瓜中分离得到MAPK15基因的完整编码序列,命名为BhMAPK15.序列分析表明,BhMAPK15开放阅读框(ORF)长1 704 bp,编码567个氨基酸.亚细胞定位预测表明,BhMAPK 15可能定位于细胞核或细胞质.以NCBI数据库为基础,从数据库中获得模式植物水稻、拟南芥和其他不同物种间的MAPK15家族成员,分析该基因与这些成员的氨基酸序列、保守基序,并构建系统进化树.经系统进化树分析表明,BhMAPK 15属于D组家族成员,与甜瓜、南瓜、黄瓜和苦瓜的相似性较高.氨基酸序列和保守基序结果表明,该基因家族成员保守性较高.实时荧光定量PCR分析表明,BhMAPK15在不同组织器官中均有表达,且非生物胁迫处理可以上调BhMAPK15的表达水平.上述研究结果表明,BhMAPK15基因可能在冬瓜响应非生物胁迫中发挥作用.
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