2017年云南省登革病毒Ⅰ型分离株NS1基因的鉴定及分析

目的 鉴定并分析2017年云南省登革病毒Ⅰ型(dengue virus I,DENV I)分离株的NS1基因.方法 采用病毒RNA提取试剂盒提取登革热(dengue fever,DF)患者血清RNA,RT-PCR法鉴定病毒类型,并扩增DENV I的NS1基因,进行测序.应用BIOEDIT软件比对NS1及DENV I标准株(DQ672562.1)的核苷酸及氨基酸序列,并进行突变分析.应用MEGA 5.1软件中的NJ法(1000 Boot strap replicate)构建NS1基因的系统进化树.结果共分离获得16株DENVI的NS1基因,经比对发现,201703、201704、201708、201709、201713分离株NS1基因第21位碱基由C变为T(无义突变);201705、201706、201712分离株NS1基因第289位碱基由T变为A(有义突变),氨基酸曲L变为M.16株分离株NS1基因其他突变位点均相同,共85处发生碱基突变,其中5个为有义突变.16株分离株与2011-ChinaDonggua (JQ048541.1)、2008-Singapore (GU370049.2)、2014-Taiwan (KU365900.1)、2005-ChinaFujian(DQ193572.1)、2016-Malaysia (KX452065.1)、2007-Indonesia(KC762646.1)、2015-SouthKorea(KP406802.1)、2006-Japan(AB178040.1)、2007-Thailand(HM469966.1)、2013-singapore(KJ806945.2)有较近的亲缘关系.结论 2017年云南省16株分离毒株均为DENV I,可能属于东南亚国家的输入性毒株.