吉林省2016年手足口病患儿肠道病毒71型VP1编码区基因分析

目的 分析吉林省2016年肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)流行株基因学特征及其变异情况.方法 采集2016年吉林省9个市、州送检的临床诊断为手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)298份标本,分离病毒获得阳性分离物,利用逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增阳性分离物VP1编码区,并对扩增产物进行核苷酸序列测定,应用Mega6和Bioedit 7.01软件分析扩增序列基因亲缘关系和氨基酸位点变异.结果 吉林省2016年分离的38株EV71同属于C4a基因亚型,并在VP1编码区共发生7处氨基酸位点的变异.结论 吉林省2016年EV71流行株与C4a代表株位于同一分支属于C4a基因亚型,且发生了多位点氨基酸变异.