2001～2014年吉林省麻疹病毒核蛋白基因变异分析

目的 分析2001～2014年吉林省麻疹病毒核蛋白(nucleoprotein,N)基因变异情况.方法 采用病毒分离、核酸提取及扩增、测序等方法获得麻疹病毒N蛋白基因序列,并通过BioEdit、Mega等生物信息学软件对所得序列进行变异分析.结果 吉林省2005、2006、2009和2014年为麻疹高发年份;麻疹病毒流行株核苷酸变异率为0.59％～1.85％,氨基酸变异率为1.00％～2.67％,氨基酸的第100位点均出现L→I的突变,可能为吉林省特异性位点,2009年第82位点出现S→G的回复性突变,且一直延续至2014年,与第47和122位点的变异处于同一病毒株上,2013和2014年第63(R→I)、69(S→T)、77(R→L)和82位(R→I)点出现一致的突变;2009、2010年麻疹病毒株错义突变率最高;第47、82、122位点的氨基酸变异持续稳定流行多年,且其熵值最高.结论 2001 ～ 2014年吉林省麻疹病毒N蛋白基因的核苷酸和氨基酸变异率随年份的推移呈波动上升趋势,建议持续监测关键位点的氨基酸变异情况,结合流行病学资料对麻疹疫情的发展提供预测预警.