酿酒酵母S288c的Rad53蛋白结构生物信息学分析

目的:分析Rad53基因核苷酸序列及其编码的氨基酸序列,利用软件推测其蛋白的二、三级结构和特征.方法:运用生物信息学相关软件对Rad53蛋白进行预测和分析,并了解其他蛋白与之相互作用关系.结果:酿酒酵母S288c的Rad53基因全长2466 bp,编码的蛋白含821个氨基酸残基,相对分子质量为12 928,是不稳定蛋白.Rad53蛋白包含3个功能域,即2个FHA功能域和1个S_TKc功能域.Rad53蛋白与DNA损伤有关,是一种中心效应蛋白激酶,与之相互作用的蛋白有MRC1、RFX1、MEC1、ASF1、DUN1、CLB5、RAD9、TEL1、CDC5和DBF4.结论:Rad53基因及蛋白的生物信息学分析为了解其他生物细胞周期进程以及肿瘤发生机制相关研究提供了重要的信息基础.