钠碘同向转运体上游增强子序列的特异性结合蛋白文库的构建及初步筛选

Letters in Biotechnology(2016)

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摘要
目的:构建酵母单杂交文库,筛选出与钠碘同向转运体上游增强子(NUE)特异性结合的蛋白质分子,进一步研究其与NUE相互作用的分子机制.方法:应用酵母单杂交系统,以NUE为酵母单杂交的“诱饵”,对甲状腺癌K1细胞的cDNA文库进行初步筛选,采用DNA测序技术及生物信息学技术对筛选的克隆进行进一步功能分析.结果:对文库中的阳性克隆测序,获得53条可读序列,Blast X比对分析及基因功能注释发现其中11条具有DNA结合功能,包括Rho GTP酶激活蛋白35(ARHGAP35)、锌指蛋白394(ZNF394)、上游刺激因子2(USF2)、SOX9等.结论:应用酵母单杂交技术初步筛选出与甲状腺癌K1细胞NUE相互作用的候选蛋白,并对这些蛋白质进行了初步的功能分析.
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关键词
sodium iodide symporter upstream enhancer,yeast-one-hybrid system,cDNA library
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