基于16S rDNA宏基因组学技术探究未知病因足部溃烂的致病因素

目的:探究未知病因足部溃烂病人的致病因素.方法:收集10例未知病因足部溃烂病人样品,提取细菌总DNA,基于16S rDNA宏基因组学技术,测序16S rDNA基因V1～V2高变区,借助生物信息学方法分析测序数据中的菌群结构,寻找病人足部溃烂可能的致病因素.结果:10份样品共产生原始测序数据260 Mbp,优势菌门包括变形菌门、拟杆菌门、厚壁菌门、放线菌门、蓝菌门和梭杆菌门,不同样品间菌群分布有差异;同时,在属水平上统计了10份样品中均出现的细菌,其中一些与伤口的慢性感染和溃疡有关,如葡萄球菌属和链球菌属在所有样本中平均含量分别达5.37％和2.16％.结论:足部溃烂病人伤口含丰富细菌基因组,发现了伤口溃疡有关细菌线索,为揭示疾病的发生和发展提供帮助.