用高斯网络模型研究钙调蛋白的构象转变
Letters in Biotechnology（2016）
摘要
目的:钙调蛋白(CaM)是细胞内的一种多功能蛋白质传感器,它可以调节细胞中各个区域的靶蛋白.研究CaM结构的动力学行为和运动趋势.方法:利用高斯网络模型(GNM)分析CaM在开放和闭合2种形式下的功能运动.结果:CaM的慢运动模式显示其构象变化主要表现为2个结构域的运动;2种形式的CaM具有共同的铰链区,铰链区位于分子的中央接头,但二者具有不同的运动倾势.交叉相关图结果显示,CaM结合Ca2+后,结构域内的相互作用会增强.结论:GNM结果可以解释先前报道的实验数据.结果有助于更好地了解CaM的构象转变规律,以及CaM底物识别和调节活动的机制.
更多关键词
calmodulin,Gaussian network model,conformational transition
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