我国近期分离的6株狂犬病病毒的糖蛋白基因序列分析

International Journal of Biologicals(2013)

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摘要
目的 分析我国近期分离的6株代表性狂犬病病毒(rabies virus,RV)的糖(G)蛋白基因序列,了解RV街毒株与疫苗株在核苷酸和氨基酸序列水平的差异.方法 对6个RV街毒株G基因进行逆转录和PCR扩增,经纯化、克隆、测序后获得6条G基因全长序列,采用生物信息学软件对G基因序列进行分析.结果6个街毒株的G蛋白在核苷酸水平的同源性为97.7% ~ 100%,在氨基酸水平的同源性为97.9% ~ 100%;与CTN-181疫苗株的核苷酸序列同源性最高,为86.7%~ 87.2%,氨基酸序列同源性为92.7%~93.1%.结论 6个RV街毒株的G蛋白在核苷酸及氨基酸水平上均有变异,但与CTN-181疫苗株关系最近,表明CTN-181疫苗株可能为我国境内流行的狂犬病提供良好的预防作用.
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关键词
Rabies virus,Glycoproteins,Genetype,Sequence analysis,DNA
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