中国7个地区诺如病毒GⅡ.4/Sydney2012变异株分析

目的 分析2012-2013年冬季中国地区诺如病毒新流行株GⅡ.4/Sydney 2012的衣壳蛋白区核苷酸与氨基酸变异特点.方法 对已获得的22份2012-2013年冬季北京地区GⅡ.4/Sydney 2012株进行全衣壳蛋白区基因扩增.从GenBank检索中国其他地区的GⅡ.4/Sydney 2012株衣壳蛋白区核苷酸序列.对获得的GⅡ.4/Sydney 2012株的衣壳蛋白区核苷酸及氨基酸序列与往年GⅡ.4流行株进行系谱分析.结果 获得中国7个地区(北京、上海、江苏、湖州、荆州、香港和台湾)的GⅡ.4/Sydney 2012株资料共38份(至少包含完整VP1核苷酸序列).GⅡ.4/Sydney 2012株之间VP1核苷酸差异为0.1％～3.3％,氨基酸差异为0～3.1％.系谱分析发现GⅡ.4/Sydney2012株与Apeldoom 2008和New Orleans 2009起自共同的分支.中国和悉尼GⅡ.4/Sydney 2012代表株的A、D、E抗原表位氨基酸序列组合有两种:TSRN-GTT-SNT和TSRN-STT-SNT.结论 GⅡ.4/Sydney 2012株已在中国多个地区出现,各地区病毒株同源性较高.GⅡ.4/Sydney 2012株的抗原表位氨基酸组合发生明显改变.