陕西省西安市及周边地区百日咳鲍特菌抗原基因型别的研究

Chinese Journal of Vaccines and Immunization(2018)

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摘要
目的 了解西安市及周边地区百日咳鲍特菌(Bp)5种疫苗相关抗原基因(ptxA、ptxP、prn、fim3和fhaB)的型别分布.方法 对2012-2014年西安市儿童医院患儿350份鼻咽拭子(NPS)标本进行BP的IS481和Ptx-pr基因检测,对双基因阳性的NPS标本进行5种疫苗相关抗原基因的扩增和测序,并与分离菌株的测序结果进行验证;分析5种抗原基因扩增的敏感性和特异性.结果 从350份NPS的190份(54.3%)中成功扩增5种基因并测序;ptxA、ptxP、prn tim3 fhaB扩增成功率分别为56.0%、61.1%、63.1%、60.0%、57.4%,其敏感性分别为67.3%、73.5%、76.0%、72.2%、69.1%,特异性均为100%.ptxA和fhaB分别只有一种基因型,ptxA1和fhaB1;ptxP、prn 、fim3分别以ptxP1、prn1 、fim3-1为主.菌株测序结果与相应NPS的测序结果一致.结论 可以直接从Bp DNA阳性的NPS中进行主要Bp抗原基因型别分析,西安市及周边地区Bp基冈型组合以ptxA1/ptxP1/prn1tim3-1/fhaB1为主.
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关键词
Nasopharyngeal swab,Bordetella pertussis,Gene sequencing
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