2015-2016年广东省珠海市风疹病毒分子流行病学研究

目的 分析珠海市2015-2016年风疹病毒基因型别和特征,为风疹控制和消除提供分子流行病学基线数据.方法 采集2015-2016年珠海市疑似风疹病例出疹后3天内的咽拭子,使用荧光逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测风疹病毒核酸,对阳性标本进行风疹病毒E1基因739个核苷酸片段(nt8731-nt9469)的扩增、序列测定和分析,与32株13个基因型的WHO参考株、中国其他省份流行的2B基因型分别构建基因亲缘性关系树.结果 2015-2016年共收集疑似风疹病例的42份咽拭子标本,其中23份病毒核酸检测阳性,经进一步扩增,18份标本获得了靶基因序列.基因亲缘性关系分析显示,18份标本均为2B基因型风疹病毒,核苷酸和氨基酸序列同源性分别为98.2％-100％和99.1％-100％,并可分成两个进化分支,不同的进化分支包含了其他省份2B基因型分离株,无地理局限性和年代相关性.18株2B基因型风疹病毒在N-型糖基化位点、抗原表位、中和抗原决定簇和血凝抑制位点没有发生突变.结论 2015-2016年珠海市流行2B基因型风疹病毒,与全国流行趋势一致.应继续加强珠海市风疹病毒分子流行病学监测.