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遂宁市乙型肝炎病毒主要基因型S区氨基酸位点置换分析

Chinese Journal of Vaccines and Immunization(2014)

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摘要
目的 分析四川省遂宁市自然人群中乙型肝炎(乙肝)病毒(Hepatitis B Virus,HBV)主要基因型S基因主要亲水区[Major Hydrophilic Region,MHR;氨基酸(Amino Acid,aa)99-169]及人类白细胞抗原Ⅰ型(The Putative Human Leukocyte Antigen Class l-Restricted,HLA-Ⅰ)细胞毒性T淋巴细胞(Cytotoxic T Lymphocyte,CTL)表位aa位点置换特点.方法 遂宁市乙肝血清流行病学调查中乙肝病毒表面抗原阳性人群,扩增HBV S基因片段并测序得到的完整S基因片段序列,进行生物信息学比对分析.结果 在遂宁市共得到108份序列,其中B基因型40份,C基因型68份,在S基因MHR发生aa置换位点为Y100C、Ql01H、Lll0F、T126A/S、T131I、S136F、T143M、G145R、V168A,在HLA-Ⅰ型CTL表位aa置换位点为V47A、P46L、T47K、L88P、I92T、L98V、Y100C、Q101H、V177A、V194A,位点置换在年龄分布和基因型分布的差异无统计学意义.结论 遂宁市HBV S基因MHR及HLA-Ⅰ型CTL表位aa位点置换与基因型分布无关,未发现接种乙肝疫苗与人群中HBV S区aa位点置换相关.
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关键词
Hepatitis B virus,genotype,amino acid,substitution
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