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2009-2017年烟台地区甲型(H1N1)pdm09流感病毒神经氨酸酶基因进化分析

Chinese Journal of Disease Control & Prevention(2018)

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摘要
目的 分析2009-2017年烟台地区甲型(H1N1) pdm09流感病毒流行情况及神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因进化特征.方法 收集2009年8月~2017年8月烟台地区两家哨点医院流感样病例咽试子标本10 236份,狗肾细胞(Madin-Darby canine kidney cell,MDCK)分离流感病毒,血凝抑制实验进行病毒分型.选取甲型(H1 N1) pdm09流感毒株43株,扩增NA基因全序列并测序,应用分子生物学软件分析其遗传变异特征.结果 系统发生分析表明大部分烟台分离株属于2、7、6C、6B.1和6B.2基因型;NA蛋白分子多个氨基酸位点发生变异,与疫苗株相比,6、7基因型增加了44位糖基化位点;6B.1和6B.2基因亚型,减少了386位糖基化位点;运用固定效应似然比模型和内部固定效应似然比模型发现34和386两个正向选择压力位点,NA蛋白酶活性中心位点及周围辅助位点均未发生变异.结论 2009-2017年烟台地区甲型(H1N1) pdm09流感病毒NA基因持续发生变异,仍对神经氨酸酶抑制剂敏感,未来仍应加强流感流行状况和病原基因特征监测.
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