改良MLVF与MLVA及PFGE对医院流行耐甲氧西林金黄色葡萄球菌分型研究
Chinese Journal of Nosocomiology(2019)
Abstract
目的 旨在建立一种操作简便、分型分辨率高以及成本低的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)分子分型方法,对多位点可变数量串联重复序列指纹法(MLVF)进行了方法学改良及分型能力比对评估.方法 应用42株MRSA参考菌株对改良MLVF分型能力进行验证;应用116株东北三省六家医院的MRSA临床菌株对改良MLVF、脉冲场凝胶电泳(PFGE)及多位点可变数量串联重复序列分析(MLVA)进行了方法学比对.结果 改良MLVF对42株参考菌株分型率为100%;改良MLVF、PFGE和MLVA分别将116株临床菌株分成28个型(simpson's多样性系数[SID]=0.855),28个型(SID=0.854)和27个型(SID=0.816).改良MLVF在区分国内最主要流行克隆CC239和其他克隆方面分辨率优于MLVA.改良MLVF在分群水平上与PFGE分型一致性(adjusted Rand's,AR系数0.989)优于MLVA(AR指数0.765).结论 改良MLVF具有分辨率高、与金标准PFGE分型一致性好、操作简单、高通量、费用低的优点,适合常规实验室对MRSA进行分子分型,为常规感控工作及分子流行病学研究提供有力工具.
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